このサイトでも使用しているMovable Typeの「Eiger」というテーマですが、ありがたいことに公式のマニュアルで、簡単な説明が公開されています。

Eiger（Movable Type 7 マニュアル）

実際にこのページに沿って設定をしていたところ、一箇所、違っていた部分があります。

「特定のウェブページをメインナビゲーションに追加する」の項で、「タグ欄に @ADDTOSITE_NAV」とあるのですが、それではメインナビゲーションには追加されず、「@ADD_TO_SITE_NAV」と入れると追加できました。

このテーマを選ぶと、自動で何ページかウェブページが作られますが、よく見ると、タグについての説明が記載されていますので、利用される方は参考にしていただけると良いと思います。